尼康生物顯微鏡結構組成有：
  (1)物鏡和目鏡是決定尼康顯微鏡性能優劣的最重要部件，它們被分別安裝在金屬鏡筒的下端和上端。為了方便地更換物鏡，在具有5^-7個孔洞的物鏡轉換臺上可以旋入不同放大倍數的一組物鏡，尼康生物顯微鏡正是借助物鏡和目鏡的兩次放大作用來觀察微小物體或物體的細微結構的。

  (2)照明器和集光器。是僅次于物鏡和目鏡的光學系統。使用燈光照明，把顯微鏡燈直接組裝在鏡座內部，或者把裝有顯微鏡燈的燈室連接在鏡座上。與日光照明相比，燈光照明亮度穩定，易于控制和調節，不受自然條件的影響。集光器是一個裝在物臺下可以沿著光軸方向垂直移動的透鏡系統，用是把照明光線聚集在被觀察的物體上。在集光器上裝有孔徑光闌，它的主要作分辨力的大小有著重要的作用。

  (3)鏡合和載物臺借助于粗調和細調的機械系統可以調節標本和物鏡之間的距離而聚焦顯微鏡像。載物臺是放置標本的臺面，一般具有可以在縱向和橫向移動的機械移動器和標本夾，并且有刻度尺和游標尺，可以隨意地移動標本，并能用于定位和測量。